В 1945–1946 гг. на геолого-географическом факультете при кафедре физической географии началась подготовка гидрологов. Организаторами были профессор С.Н. Лаптев, ассистенты А.С. Шкляев и Л.И. Дубровин, а также совместители: главный инженер КамБУП П.А.Леонов и начальник технического отдела этого управления известный гидролог В.В. Федоров.
В 1969 г. на географическом факультете была открыта кафедра гидрологии суши.
С 1969 по 1974 гг. кафедрой заведовал доктор географических наук, профессор, проректор по научной работе университета А.С. Шкляев.
С 1974 по 1997 гг. заведующим кафедрой был доктор географических наук, профессор, Заслуженный деятель науки и техники РФ, академик РАЕН, РЭА, МАН ВШ Ю.М. Матарзин, являющийся основателем Пермской научной школы гидрологии водохранилищ.
С 1997 по 2017 гг. заведующим кафедрой была доктор географических наук, профессор, С.А. Двинских.
В настоящее время кафедру возглавляет доктор географических наук В.Г. Калинин.