На базе кафедры биогеоценологии и охраны природы созданы ряд лабораторий:
• Лаборатория экологии и охраны природы;
• Лаборатория эколого-геоинформационных систем.
Фундаментальные исследования.
• Изучение антропогенной трансформации экосистем.
• Разработка концептуальных основ устойчивости экосистем особо охраняемых природных территорий (ООПТ) и антропогенной трансформации экосистем.
• Разработка теории и моделей устойчивости экосистем, разработка концептуальных основ восстановления природно-техногенных экосистем.
• Разработка концепции устойчивого регионального природопользования на основе знаний об антропогенной трансформации экосистем (2013-2017 гг.).
• Проведение ежегодной Международной школы-семинара молодых ученых – научные чтения памяти Н.Ф. Реймерса и Ф.Р. Штильмарка «Антропогенная трансформация природной среды».
• Выпуск научного журнала «Антропогенная трансформация природной среды».
Прикладные исследования.
• Разработка сети особо охраняемых природных территорий Пермского края. В рамках этого исследования выполнена генеральная схема и проекты двух государственных заповедников, заказников, природного парка, выполнено более 30 конкретных проектов районных сетей охраняемых природных территорий. Изданы «Красная книга Среднего Урала», «Красная книга Пермского края», «Атлас особо охраняемых природных территорий Пермского края». База данных особо охраняемых природных территорий Пермского края.
• Инвентаризация зеленых насаждений г. Перми
• Кафедрой подготовлено 4 региональных закона, в том числе «О природном наследии Пермского края», «Об охране окружающей среды Пермского края».
• Изучение проблем экологического образования и воспитания. Кафедра участвовала в разработке государственных образовательных стандартов и учебных планов экологических специальностей для университетов России.