Структура Естественнонаучного института

Административно-хозяйственный отдел:
- административное подразделение
- хозяйственное подразделение
- финансово-экономический отдел
- библиотека
- научно-исследовательская лаборатория Маркетинговых исследований и разработок «Research&Development Marketing.LAB»
- научно-исследовательская лаборатория биогеохимии техногенных ландшафтов
- научно-исследовательская лаборатория геологии техногенных процессов
- научно-исследовательская лаборатория химических технологий
- научно-исследовательская лаборатория экологической геологии
- научно-исследовательская лаборатория устойчивого лесопользования
- научно-исследовательская лаборатория «Проект»
- научно-исследовательская лаборатория молекулярной биологии и генетики
- научно-исследовательская лаборатория технологической минералогии
- научно-исследовательская лаборатория биотехнологий
- научно-исследовательская лаборатория геологии осадочных и техногенных месторождений
- научно-исследовательская лаборатория геологического моделирования и прогноза
- научно-исследовательская лаборатория минералого-петрографических исследований