Проект «Создание биосенсора для детекции и мониторинга стойких органических загрязнителей (полихлорированных бифенилов) в компонентах окружающей среды с использованием бактериальных клеток и микрожидкостного чипа»


Новости

07.10.2015 - На биологическом и физическом факультетах обсудили современные методы, используемые при создании цельноклеточных бактериальных биосенсоров
05.10.2015 - В ПГНИУ завершился второй этап работ по созданию биочипа для детекции опасных органических загрязнителей 
28.09.2015 - В ПГНИУ состоится двухдневный семинар "Современные методы, используемые при создании цельноклеточных бактериальных биосенсоров"
03.07.2015 - В ПГНИУ состоялся семинар "Создание генетических конструкций для клеточного биосенсора на платформе микрожидкостного чипа"
06.03.2015 - В ПГНИУ завершился первый этап работ по созданию биочипа для детекции опасных органических загрязнителей
14.11.2014 - В ПГНИУ учёные биологи и физики на научном семинаре представят проект совместных исследований
Срок выполнения проекта:
17.06.2014 - 31.12.2015
 
Цели выполнения прикладных научных исследований:
1. Разработка нового методического подхода, направленного на биодетекцию токсичных органических соединений (полихлорированных бифенилов, ПХБ) в компонентах окружающей среды, и прототипа технического решения проблемы определения концентраций ПХБ в образцах почвы и воды. 
2. Создание биосенсорной технологии определения ПХБ в почве, водных объектах на платформе микрожидкостного чипа и целых бактериальных клеток-биорепортеров.
3. Изготовление экспериментальных образцов микрочипов.
4. Проведение экспериментов (испытаний) по определению ПХБ в модельных и природных образцах.
5. Оформление научно-методических и нормативно-технических документов по технологии создания биосенсора.
6. Описание методики исследований загрязненных почв, донных отложений, воды, модельных соединений-стандартов.
 
Заказчик:
Министерство образования и науки Российской Федерации
 
Исполнитель:
ФГБОУ ВПО «Пермский государственный национальный исследовательский университет», ректор д. ф-м. наук Макарихин Игорь Юрьевич
 
Соисполнитель:
ФГБУ науки Институт биохимии имени А.Н.Баха РАН (ИНБИ РАН, г. Москва); директор чл.-корр РАН, д.х.н., проф.  Попов Владимир Олегович

Индустриальный партнер:
ООО «Природоохранные технологии»,
директор к.г.-м.н., Максимович Николай Георгиевич
 
Софинансирование проекта:
Естественнонаучный институт ПГНИУ, 
директор д.г.-м. н. Наумов Владимир Александрович
 
Проект реализуется на кафедре ботаники и генетики растений биологического факультета (молекулярно-генетическая (ПЦР) лаборатория),
на кафедре общей физики физического факультета (лаборатория микрофлюидики), в лаборатории молекулярной биологии и генетики ЕНИ ПГНИУ.

Первый этап проекта:
17.06.14 – 31.12.2014 
«Теоретические и практические подходы к созданию биосенсера с применением технологии микрожидкостного чипа»
 
Содержание работ на 1 этапе проекта:
1) Подбор клеточных (бактериальных) культур, генетических структур (репортерных генов, векторных систем и др.) для создания необходимых генетических конструкций.
2) Отбор образцов почв и донных отложений, загрязненных ПХБ (полихлорированных бифенилов), и оценка концентрации ПХБ аналитическими методами.
3) Разработка топологии микрожидкостного чипа в соответствии с выбранной клеточной (бактериальной) культурой.
4) Подбор условий использования загрязненных образцов (почвы, донных образцов, воды и др.) при применении технологии микрожидкостного чипа  и биосенсора (генетически модифицированные клетки бактерий).
5) Определение ПХБ аналитическими методами в искусственно загрязненной (модельной) почве.

Научный руководитель проекта 
доктор биологических наук  по сп. «Микробиология», 
профессор кафедры ботаники и генетики растений,
в.н.с. НИЛ «Молбиоген» ЕНИ ПГНИУ
Плотникова Елена Генриховна

Отв. исполнитель проекта
Зав. кафедрой ботаники и генетики растений, в.н.с. НИЛ «Молбиоген» ЕНИ,
доктор биологических наук по сп. «Генетика», профессор
Боронникова Светлана Витальевна


Представитель соисполнителя: 
Научный сотрудник лаборатория биохимии стрессов микроорганизмов ИНБИ РАН, к.б.н. 
Шумков Михаил Сергеевич

Исполнители проекта
Доцент каф. ботаники и генетики растений, к.б.н.
Назаров Алексей Владимирович


Ведущий научный сотрудник НИЛ «Молбиоген» , к.б.н.
Шумкова Екатерина Сергеевна
Доцент каф. ботаники и генетики растений, н.с. НИЛ «Молбиоген» ЕНИ, к.б.н. 
Бельтюкова Надежда Николаевна
 
Ассистент каф. ботаники и генетики растений, м.н.с. НИЛ «Молбиоген» ЕНИ
Нечаева Юлия Сергеевна

Зав. лабораторией микрофлюидики кафедры общей физики физического факультета  
Отрощенко Анатолий Анатольевич

Инженер-исследователь НИЛ «Молбиоген» ЕНИ
Воронина Анна Олеговна ЕНИ
 
Студентка 5 курса физического факультета
Макарихина Галина Игоревна
 

 
Уникальные научные установки (УНУ)
В ходе реализации проекта используются три внутренние уникальные научные установки.
 
Показатели результативности и основные результаты проекта
3 квартал 2014 г. (pdf)
I этап проекта (17 июня - 31 декабря 2014 г.) (pdf)