На биологическом и физическом факультетах обсудили современные методы, используемые при создании цельноклеточных бактериальных биосенсоров

5-6 октября в Пермском университете состоялся семинар «Современные методы, используемые при создании цельноклеточных бактериальных биосенсоров». Семинар прошел в рамках проекта «Создание биосенсора для детекции и мониторинга стойких органических загрязнителей (полихлорированных бифенилов) в компонентах окружающей среды с использованием бактериальных клеток и микрожидкостного чипа» по Соглашению №14.574.21.0028 от 17 июня 2014 г. ФЦП «Исследования и разработки по приоритетным направлениям развития научно-технологического комплекса России на 2014 - 2020 годы».

На семинаре присутствовали:

- Представитель Индустриального партнера ООО «Природоохранные технологии»;

- Институт экологии и генетики микроорганизмов УрО РАН (г. Пермь);

- десять участников проекта;

- три сотрудника «Химэксперт» (г. Москва);

- два сотрудника «Termofisher Sciens» (г. Москва);

- девять сотрудников ФГУН «Институт экологии и генетики микроорганизмов УрО РАН (ИЭГМ, г. Пермь);

- пять сотрудников ПГНИУ;

- один сотрудник ГБОУ ВПО «Пермская государственная фармацевтическая академия»;

- один аспирант ПГНИУ и четыре аспиранта ИЭГМ УрО РАН, пять магистрантов ПГНИУ, три студента ПГНИУ, один студент ГБОУ ВПО «Пермский государственный медицинский университет».

Из 44 присутствующих возраст менее 39 лет у 30 человек.

 

Семинар провели руководитель проекта д.б.н. Елена Плотникова и отв. исполнитель проекта д.б.н., проф. Светлана Боронникова.

 

Повестка дня семинара:

5 октября (13.30-18.30, ауд. 322, корп. №8,Vip-зона)

Секция 1.

1. «Введение в проблему создания цельноклеточных бактериальных биосенсоров», руководитель проекта ФЦП, д.б.н. Елена Плотникова;

2. Доклад «Лаборатория на чипе», докладчик: инженер-исследователь Анатолий Отрощенко.

 

6 октября (13.30-18.30, ауд. 322, корп. №8,Vip-зона)

Секция 2.

1. «Геномные и биосенсерные технологии», отв. исполнитель проекта, д.б.н. Светлана Боронникова;

2. Краткое сообщение «Разработка программного обеспечения для анализа флуоресцентного сигнала при работе биосенсора», докладчик: лаборант-исследователь Андрей Жуланов.

 

Заказчик проекта: Министерство образования и науки Российской Федерации.

Исполнитель: ФГБОУ ВПО «Пермский государственный национальный исследовательский университет», ректор, д. ф-м. наук Игорь Макарихин;

Соисполнитель: ФГБУ науки Институт биохимии имени А.Н. Баха РАН (ИНБИ РАН, г. Москва), директор чл.-корр РАН, д.х.н., проф. Владимир Попов;

Индустриальный партнер: ООО «Природоохранные технологии», директор, к.г.-м.н., Николай Максимович;

Софинансирование проекта: Естественнонаучный институт ПГНИУ, директор, д.г.-м.н. Владимир Наумов.
 

Проект реализуется на кафедре ботаники и генетики растений биологического факультета (молекулярно-генетическая (ПЦР) лаборатория), на кафедре общей физики физического факультета (лаборатория микрофлюидики), в лаборатории молекулярной биологии и генетики ЕНИ ПГНИУ.

 

В работе семинара приняли участие: представитель соисполнителя ФГБУ науки Институт биохимии имени А.Н. Баха РАН (г. Москва); сотрудники Института экологии и генетики микроорганизмов УрО РАН (г. Пермь); сотрудники агентства «Химэксперт» (г. Москва): к.б.н. А. Плугов, к.б.н. И. Волков, Е. Агеева; представитель компании «Thermal Fisher Science» (г. Москва) Н. Новожилова.

 

Третий этап проекта (1 июля – 31 декабря) «Испытания экспериментального образца биосенсора и разработка научно-технической документации».

Содержание работ и основные результаты в 2015 г. (на 2 и 3 этапах проекта): созданы генетические конструкции; разработан экспериментальный образец биосенсора для определения ПХБ на микрожидкостном чипе (МЖЧ) с использованием бактериальных клеток-репортеров E. coli; разработано программное обеспечение для анализа флуоресцентного сигнала при работе биосенсора; проведены испытания экспериментальных образцов биосенсора при различном уровне загрязнения ПХБ, проведены исследования экспериментальных образцов биосенсора при разных параметрах загрязнений.

Установлено, что биосенсор может быть использован для успешной детекции ПХБ в опытных (техногеннозагрязненных) образцах почв, донных отложений с различными физико-химическими параметрами (засоленность, pH); подготовлены и поданы две заявки на патенты; разработаны предложения и рекомендации по коммерциализации результатов ПНИ, вовлечению их в хозяйственный оборот.

Биосенсор предполагается использовать в области мониторинга состояния окружающей среды: для исследования содержания ПХБ в почве и водных системах с целью выявления загрязнений и для наблюдения за процессом ремедиации загрязненных почв.

 

Участники семинара обсудили проблемы создания микрожидкостных чипов и полученные результаты.

В ходе выполнения проекта используются три внутренние Уникальные научные установки (УНУ).
 

Секция 2. Геномные и биосенсерные технологии.
Отв. исполнитель проекта, д.б.н., проф. Светлана Боронникова